生物醫學碩士班集合醫學系基礎學科師資共同運作，以各領域專長從事多面向生物醫學研究，發展特色重點包括：生物分子結構與功能、治療發炎與癌症藥物研發、寄生蟲動物感染模式、中醫藥成份鑑定與與功能研究、微生物病毒與疾病的關聯、超級菌株之監控與防治、宿主對病原體抵抗機制、神經傷害與塑性、呼吸性疾病致病機轉、日變節律與代謝症候群之關聯、細胞凋亡與再生之研究、壓力調控神經機轉等相關研究。